余某系A村村民，经批准取得合法用地手续，在A村荒地上建起了砖瓦厂。但该块地的粘土很快被采掘枯竭，余某为继续经营砖瓦厂，便与村委会协商，希望能从本村另外8亩耕地由砖瓦厂使用，村委会同意了他的要求。随后，余某与村里签订了“土地使用协议书”，由余某向村里缴纳种植补偿费共38000元。余某同时还与本村村民谢某和赵某达成协议，在支付一定费用后将该二人承包的基本农田8亩用于取土。数月后被村民举报，市土地管理局对余某的行为进行了查出。

问：余某与村委会签订的用地协议是否合法有效？请说明理由。