李老板在业内一直颇受赞誉，他对员工的体恤也是人人皆赏。在十年前，公司还只有5个人的小公司时，李老板就把所有的员工的利益放在了最重要的位置，他经常说：“只要跟着我，我绝对不会让大伙儿失望，我喝粥就让大家吃饭，我吃饭就让大伙吃肉”。公司员工从5个人扩展到了20人、100人，可是老板的方针依旧没有变，每个月拿薪水的时候，人人脸上都洋溢着笑意，老板的美名一时之间无人不知。可是最近这种现象却悄然发生了变化，员工与老板之间也不再那么亲密了，这是怎么回事呢？原来，经过多年的苦心经营，公司先后成立了多家附属公司，去年李老板完成了一个重要的事情——正式成立了集团公司，所有的管理收归于下，这是一件大喜事，自然，李老板又想要调节大家的士气：“咱们就来点儿直接的，涨工资”。在一片欢呼声中，按照人力资源部高主任的建议，公司在短短1个月内就完成了薪酬体系的改革，当然最主要是普调了大家的工资，可是工资调整后，李老板却发现员工的积极性似乎并没有显著的提高，有些人怨气似乎还很大，工作效率也没什么提高。更让他费解的是，到了年终一算账，工资开支增加了不少，可公司的整体利润却不升反降，没过多久，一直在关键岗位上表现优异的员工甲，忽然间要求辞职，这可急坏了李老板。后经了解才明白，原来甲认为“其他企业工作的人现在的工资都已经5000元/月了，我盼涨工资盼了有一年多了，才涨了300块，还不够塞牙缝的呢！乙不就是搞搞后勤工作嘛，哪里像我这样承担这么多任务和职责？但是他居然也涨了300块钱！这几年我一直努力工作，但是这次涨薪，看来和工作表现没有什么关系，以后再也不用这么玩命干了！这次薪酬调整说是普涨，是不是有很多人因为和老板走的近而涨得更多呢？”知道原因后的李老板想了想，决定找专业人员对公司的薪酬系进行调整。
请回答下列问题：
请你根据所学的知识，介绍一下如何设计一个科学合理的薪酬体系。