2009年3月初，某水泥厂计划投资建设新的水泥生产线。为向新生产线提供原料，水泥厂在未办理采矿登记手续的前提下，在本厂矿山开采区域内采用深孔爆破方式开采出大量水泥用石灰岩，供本厂生产使用。2011年3月，当地国土资源局根据《矿产资源法》及其《实施细则》的规定，对其作出处罚，责令其立刻停止无证开采行为，没收违法所得并处罚款。问：(1)水泥厂的行为主要有哪些违法之处？(2)国土资源局对水泥厂的处罚是否合法？为什么？