某科研所在某县城南占地4831．08平方米。由于县城规划城南道路要从其猪场中心经过，用去猪场土地面积1706．25平方米，于是该所在没有向县土地管理部门办理申请用地手续的情况下，擅自以拆猪场为名，与私人签订协议，将18户住宅和巷道地共2724．43平方米出卖给本所的千部、职工建住宅。县土地管理部门发现后，对此案进行了立案查处。后报经批准依法作出了收回科研所非法转让的2724．43平方米土地使用权的处罚决定。问：科研所的行为有哪些违法之处？